《甘肃农业科技》的前身是《农业科技简讯》，创刊于 1963年，1970年改名为《甘肃农业科技简讯》，1973年更现名。1980年经中共甘肃省委宣传部批准向国内公开发行，1988年经国家科委和新闻出版署批准向国内外公开发行。历经50多个春秋，尤其是第一次全国科学技术大会以来，经全体编辑人员的辛勤耕耘，《甘肃农业科技》已成为西北地区乃至国内有较大影响的农业科技期刊之一。

据河北省农科院曹建儒同志1991年采用模糊线性加权法对135种期刊进行综合评判，在确定的21种旱作农业主题核心期刊中，《甘肃农业科技》名列第3位。据王立对1992—1994年我国土壤肥料学科论文统计，《甘肃农业科技》为土壤肥料学科核心期刊，在国内省级农业科技期刊中名列第1位。据李红对1992—1995年我国农业期刊园艺学科论文数量的统计分析，在省级农业科学期刊中《甘肃农业科技》与《华北农学报》并列园艺学科论文数的第1位。据郭杰光等人采用文献计量学方法对节水农业文献数据库涉及的338种专题期刊进行统计分析，《甘肃农业科技》载文量居第1位，为该学科一级期刊。

《甘肃农业科技》1989年起被《中国核心期刊（遴选）数据库》收录，2003年入选《中国学术期刊综合评价数据库（CAJCED）》统计源期刊和《中国期刊全文数据库（CJFD）》全文收录期刊。同时，《甘肃农业科技》1986年获国家科技情报成果二等奖，1989、1996年分别获中国农口学会首届、第二届优秀期刊评比优秀期刊奖，1997年获第二届全国优秀科技期刊评比三等奖，2002年获第三届全国优秀农业期刊二等奖,2003年获首届《CAJ-CD规范》执行优秀期刊奖, 2004年获第四届全国优秀农业期刊二等奖,2008年获甘肃省优秀期刊奖。